清军退出了关外，由于李国栋的布局，这次清军入寇损失惨重，仅仅是真满八旗兵，就折损了一万多人，加上科尔沁蒙八旗、汉军旗和外藩蒙古的损失，清军共折损了四万多人，郡王岳托被杀，岳托的两儿子一个被俘一个被杀，阿巴泰贝勒被杀，另折损了牛录章京十九人，甲喇章京六人，梅勒章京两人，蒙古将领被杀六人，汉八旗将领被杀五人，可以说是老奴起事以来，清军对上明军最惨重的一次败仗。
大明的损失远比真实历史上减少了许多，原本清军劫掠了人口四十六万，这次被李国栋击败，结果大部分被掳的汉人都逃跑了，清军只获得了二十多万被掳人口，还是加上了李宏攻破了几座城池，掳掠了士绅、商人的家人和奴仆五万多人，才达到二十多万。
清军出关了，李国栋和他的两万余大军在济南城内住了一个多月，这段时间他受到德王款待，每天好吃好喝的供着。得到清军出关的消息，李国栋才押着俘虏，带着斩获的首级进京献俘。
崇祯十二年二月初六，李国栋率军前往京城，同行的有洪承畴、颜继祖、杨国柱、虎大威等人。
至于清军入寇之后，就一直躲在德州的刘泽清，他自知罪孽深重，根本就不敢进京面圣。刘泽清知道，自己这样的军阀，只要军队在手，不管做多少坏事，朝廷都拿自己没办法。这次清军横行山东，一直杀到胶东，攻破十多座城池，就连曲阜圣地都被清军攻破了，衍圣公一家惨遭毒手，这件事影响极其恶劣，刘泽清知道自己若是进了京，就别想活着回来了。
可是山东巡抚颜继祖他却不得不进京面圣，哪怕知道进京可能会被崇祯皇帝拿下押入死牢，他也只能进京。若是抗旨不遵，说不定崇祯皇帝一怒之下，灭了他三族都有可能。就算崇祯愿意放过他，天下读书人都不会放过他，毕竟曲阜城破，衍圣公一家被灭的事情在读书人之中影响力太大了，这件事不逊于张献忠烧毁凤阳皇陵。
张献忠烧毁了凤阳皇陵，只是引起了崇祯皇帝龙颜大怒；可是曲阜圣地被毁，这件事引起了天下士子的公愤。天下所有读书人，都恨不得把颜继祖给生吞活剥了。
虽然罪责最大的是刘泽清和倪宠等将领，因为他们畏敌如虎，不听朝廷调兵诏令，拥有十多万重兵却在德州龟缩了近半年，导致清军在山东境内如入无人之境，横行肆虐了近半年时间，导致山东各地遭到惨重的损失，论罪，这些将领都该斩首。可是颜继祖心中十分清楚，如今已经是乱世了，文贵武贱这一点事实上已经失去了意义，崇祯皇帝可以像杀狗一样杀文官，却不敢动那些手中有兵的武将。
进京路上，颜继祖心中忐忑不安，他觉得，唯一能让自己看到一线生机的就是李国栋的大功了，济南一战，斩杀岳托、罗洛浑，生擒罗洛宏，歼敌一万五千余人，这可是实打实的一万五千多清军啊！虽然其中大部分都是假奴，可是这也是山东境内最大的一次大捷了。
可是李国栋的功劳能让颜继祖活命的机会很小，因为济南大捷的时候，颜继祖人在德州，之前济南送来三次求援信，颜继祖都不敢出兵去救济南。所以说，济南大捷的功劳和他基本上是没关系了，而曲阜失陷的罪，却和他有关。
运河的冰已经化了，李国栋的两万一千晋阳军大军乘坐运河船只北上。二月十四，满载着晋阳军的船只刚刚过了通州，礼部官员密集前来，对这只得胜大军慰劳。同时礼、吏、兵三部准备的凯旋庆贺宴席各项注意文书也送入晋阳军中，让各将详加准备。
当日下午，大军沿着永定河抵达左安门外，随后大军下船，步行至永定门外。
大军驻扎永定门外，京师百姓如潮水般涌来，围观犒劳这支得胜之师。
次日，卢象升的天雄军、部分宣大军，以及王全的淮军也来了。作为巨鹿大捷的大功臣，王全自然是同卢象升一起的。在名义上，王全的淮军不属于李国栋管辖，两人所属的体系都不同，李国栋的晋阳军是募兵，王全的淮军是军户。
十六日，晋阳军即将入城献俘。
天还未亮，城内百姓就已经纷纷起床了，站在永定门内的正阳门大街两边等候。
城外，李国栋、杨国柱、虎大威等将领披挂了盔甲，李国栋头戴御赐凤翅盔，身穿御赐明光铠，披着白色披风，胯下一匹白色骏马，手中马槊的红缨也换成白樱，威风凛凛，宛如常山赵子龙再世。